Новосибирский зоопарк создан в 1933 году.

В 2000 году коллекция зоопарка была представлена 423 вида, 9 906 экземпляров.

В 2005 году со старой территории переехали последние животные и была переведена администрация зоопарка. 

В 2007 году завершено строительство павильона «Тропический мир», где оформлены выставки тропических животных, ночной мир, морские и пресноводные аквариумы. В короткие сроки построен входной блок с прилегающей площадью. Во входном блоке разместилась администрация, лекторий, планируется строительство террариума.

В 2007 году зоопарк отметил 60-летие. В рамках празднования юбилея проведена Международная конференция «Роль зоопарков в охране животного мира», в которой приняли участие представители 35 зоопарков 12 стран мира. Кроме Новосибирского зоопарка, гости ознакомились с работой биостанции в Карасуке. Все участники конференции дали высокую оценку проведенной зоопарком работе по сохранению редких и исчезающих животных нашей планеты.

В 2008 году впервые в Новосибирском зоопарке получено потомство от мартышки Диана (впервые в России), голубого барана, овцебыка, такина (впервые в России), белого тигра.

Закончено строительство вольер для белых медведей, вольерного комплекса для тропических животных.
 

В настоящее время в Новосибирском зоопарке содержится около 10 000 особей 756 видов животных. Более 350 видов занесены в Международную Красную Книгу, Красную Книгу России и Новосибирской области. На 77 видов ведутся международные племенные книги. Коллектив зоопарка участвует в 67 международных программах по сохранению редких и исчезающих видов животных. В Новосибирском зоопарке собрана одна из лучших в мире коллекций представителей семейства кошачьих и куницеобразных. Зоопарк является членом 3-х международных союзов: EAZA (Европейская Ассоциация Зоопарков и Аквариумов), ЕАРАЗА (Европейско-Азиатская Региональная Ассоциация Зоопарков и Аквариумов), WAZA (Международная Ассоциация Зоопарков и аквариумов). Участвует в международной компьютерной программе ISIS.

Эмблемой Новосибирского зоопарка стал снежный барс - уникальное по красоте и грации животное, сохранившееся в Сибири только на Алтае.

Всего Новосибирский зоопарк контактирует более чем со 150 зоопарками 44 стран мира. С 1989 года произведено более 100 обменов животными с зарубежными партнерами 25 стран мира.